Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTDSP2O14595 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTDSP2O14595 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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