Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USP9YO00507 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP9YO00507 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms