Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms