Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM149AA5PLN7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms