Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0J9YYE9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms