Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1BQ9UPS6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms