Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNA3Q9UI47 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms