Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TFIP11Q9UBB9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms