Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms