Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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