Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BPESC1Q9GZL8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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