Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC4A5Q9BY07 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms