Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms