Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZBED2Q9BTP6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms