Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT11Q9BT88 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT11Q9BT88 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms