Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP88Q99567 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms