Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms