Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3AQ96ST3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms