Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms