Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms