Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COPS9Q8WXC6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COPS9Q8WXC6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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