Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMER3Q8N944 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms