Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBRM1Q86U86 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBRM1Q86U86 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms