Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBA3EQ6PEY2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms