Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms