Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FOXD4Q12950 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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