Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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TFF3Q07654 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TFF3Q07654 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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