Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms