Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NHLH2Q02577 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NHLH2Q02577 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms