Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA2P51531 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA2P51531 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms