Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms