Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXLNAP40222 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms