Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BRS3P32247 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms