Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC13P31276 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms