Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms