Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAM1P18669 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms