Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NME1P15531 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NME1P15531 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME1P15531 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME1P15531 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms