Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL3O43909 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms