Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms