Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms