Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms