Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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