Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms