Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms