Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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