Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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PFDN4Q9NQP4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PFDN4Q9NQP4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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