Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms