Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD1Q9BXT4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms