Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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