Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms